糞肥中含有豐富的有機質和作物所需要的各種營養元素，對增加作物產量和提高土壤肥力具有良好的作用，一直以來都被廣泛應用于農業生產中。古時候就流傳著“糞多則肥多，肥多則田沃，田沃則谷多”的說法。近年來，隨著糞肥不合理的施用現象增多，各種問題也隨之而來。
畜禽糞成分主要是纖維素、半纖維素、木質素、蛋白質及其分解成分、脂肪、有機酸、酶和各種無機鹽類。
豬糞含有機質15%，氮0.5%，磷0.5～0.6%，鉀0.35～0.45%。豬糞的質地較細，成分較復雜，含蛋白質、脂肪類、有機酸、纖維素、半纖維素以及無機鹽等。因含氮素較多，故碳氮比例較小，約為14：1，一般容易被微生物分解，釋放出可為作物吸收利用的養分。
豬糞含腐植質最高，陽離代換量最大，保肥力最強，但含水量較多，纖維素分解菌較少，混合少量馬糞施用，以接種纖維素分解菌，能夠大大增加肥效。
牛糞含有機質14.5%，氮0.30～0.45%，磷0.15～0.25%，鉀0.10～0.15%。有機質和養分含量在各種家畜中較低，質地細密，含水較多，分解慢，發熱量低，屬遲效性肥料。牛糞中由于含水量較高，通氣性較差，有機質部分較難分解，是冷性肥料，把鮮糞晾干，再加馬糞混合堆積，可得疏松優質有機肥料。
馬糞含有機質21%，氮0.4～0.5%，磷0.2～0.3%，鉀0.35～0.45%。馬糞成分中以纖維素、半纖維素含量較多，此外，還含有木質素、蛋白質、脂肪類、有機酸及多種無機鹽類。馬糞中水分易于蒸發，同時含有較多的纖維分解菌，是熱性肥料，施用馬糞可以改善粘土的性質。
羊糞 羊糞蛋
羊糞含有機質24～27%，氮0.7～0.8%，磷0.45～0.6%，鉀0.4～0.5%。羊糞含有機質比其它畜糞多，糞質較細，肥分濃厚。
羊糞發熱介于馬糞與牛糞之間，亦屬熱性肥料，也被稱為溫性肥料，在砂質土和粘質土上施用，效果好。
禽糞 雞糞干
禽糞中含有機質25.5 %， 氮1.63%，磷1.54 %，鉀0.85%，碳水化合物11%，纖維7%，新鮮禽糞含水量較高。
禽糞(雞糞、鴨糞、鵝糞、鴿糞等)中氮素以尿酸態為主，尿酸不能直接被作物吸收利用，而且對作物根系生長有害，同時，新鮮禽糞容易招引地下害蟲。
所含的養分比較全面，肥效穩定而持久。不但含有各種大量和中微量營養元素，而且含有一些能刺激根系生長的物質以及各種有益土壤微生物。
改善土壤結構。含有豐富的腐植酸，能促進土壤團粒結構的形成，使土壤變得松軟，改善土壤水分和空氣條件，利于根系生長；增加土壤保肥保水性能；提高地溫，促進土壤中有益微生物的活動和繁殖等。 調節土溫。糞肥有熱性，溫性和涼性之分，具有調節土壤溫度的功效。 ● 未腐熟糞肥，特別是禽糞含鹽分較重、易使土壤鹽化，升高土壤鹽濃度，嚴重時會導致種子不發芽、燒苗、燒根。還會產生有害氣體，毒害植物。
● 禽畜糞便中較多病菌、蟲卵，雜草種子等，不經高溫發酵，很容易給植物帶來不良影響，同時還易引病蟲害。
● 部分糞肥由于來源問題，可能微量元素含量超標，甚至是含有重金屬、抗生素等，會毒害植物，影響農產品安全。
● 糞肥因雜質較多，純度偏差極大，含量極不穩定，單一施用時無法保證施用養分含量及效果。
糞肥腐熟后，分解快有利于植物吸收，同時在60-70℃的高溫厭氧環境下，有害蟲卵、雜草種子大部分會死亡。
糞肥的腐熟目前有三種常用的方法：
一是結合高溫悶棚進行糞肥腐熟。夏季棚室休閑期長，可結合高溫悶棚進行糞肥腐熟，腐熟發酵的過程也是改良土壤的過程。在發酵腐熟過程中，土壤中的微生物非?；钴S，能夠促進土壤團粒結構的形成。
二是棚外堆悶。有足夠的時間可以自然堆漚發酵，而時間較短時可以在堆悶腐熟時使用生物腐熟劑。
三是使用菌劑快速發酵。常用的有ETS菌群等，能縮短發酵腐熟時間。
有些大棚土壤沙性大，漏水漏肥的情況嚴重，因此糞肥應選擇純雞糞或純豬糞，這種糞肥純度較高，養分含量也高，因為糞質比較黏重，對漏肥漏水的沙土地有良好的改良作用。黏性土應施用有機質含量高而礦質元素含量少的糞肥，如羊糞、牛糞，或者是含有沙子、稻殼、秸稈的雞糞、豬糞等，能夠改善黏性土壤的物理性狀，提高其透水透氣能力。這樣的糞肥也非常適合改良土壤鹽漬化板結較為嚴重的棚室土壤。大量的糞肥集中在地表10~15厘米的土壤當中，雖然與土壤進行了混合，但糞肥仍然比較集中，即使已經腐熟的糞肥，在用量如此之大、翻耕深度較淺的情況下，也會影響根系生長。所以施用糞肥以后應進行深翻，一般翻耕深度要超過30厘米。糞肥中雖然含有的養分全面，但是總量達不到作物的吸收利用量，所以糞肥與化學肥料配合使用可以降低化學肥料殘留對土壤造成的影響，同時保證化學肥料中的養分能夠及時被作物吸收利用。糞肥與生物菌肥配合使用可以加快糞肥的分解，加快土壤改良的速率。糞肥中的物質可促進生物菌的繁殖，鞏固有益菌對根系產生的保護和促生效果。糞肥對土壤改良有一定的作用，但效果比較慢，所以配合含礦源腐植酸、海藻提取物等多種生物刺激劑的海精靈效果更佳，此外海精靈還能刺激植物野性，促進植物基因最優表達。
